Forum für Killifische, Cichliden und Welse - KCW-Forum
»
Themen zu sonstigen Fischarten
»
Salmler
»
Ein kontinentweiter molekularer Ansatz zur Aufklärung der mtDNA-Diversität und der geographischen Verbreitung der neotropischen Gattung Hoplias
Ein kontinentweiter molekularer Ansatz zur Aufklärung der mtDNA-Diversität und der geographischen Verbreitung der neotropischen Gattung Hoplias
Autoren
Yamila P. Cardoso, Juan J. Rosso, Ezequiel Mabragaña, Mariano González-Castro, Matías Delpiani, Esteban Avigliano, Sergio Bogan, Raphael Covain, Nahuel F Schenone, Juan M. Díaz de Astarloa
Veröffentlicht: 13. August 2018https: //doi.org/10.1371/journal.pone.0202024
Abstract
Mit schätzungsweise 9.000 Arten beherbergt die neotropische Region die größte Vielfalt an Süßwasserfischen der Welt. Genetische Untersuchungen haben das Potenzial, isolierte und einzigartige Abstammungslinien zu entwirren und können zur Identifizierung von noch nicht beschriebenen Arten führen, was die Katalogisierung der vorhandenen Artenvielfalt beschleunigt. In dieser Arbeit wurde die molekulare Diversität innerhalb der wertvollen und weit verbreiteten neotropischen Gattung Hoplias mittels DNA Barcoding untersucht. Die geografische Abdeckung umfasste 40 Breitengrade von Französisch-Guayana nach Argentinien. Unsere Analysen ergaben 22 mitochondriale Linien, die vollständig durch Barcode Index Number, automatische Barcode Gap Discovery und phylogenetische Analysen unterstützt wurden. Diese mtDNA-Untersuchung ergab die Existenz von 15 vollständig unterstützten mitochondrialen Linien innerhalb des einst als kontinental verteilten H. Malabaricus. Nur vier von ihnen werden derzeit als gültige Spezies beschrieben, wobei 11 mitochondriale Linien innerhalb dieses Artenkomplexes "maskiert" werden. Die mittlere genetische Divergenz betrug 13,1%. Barcoding-Gap-Analyse diskriminierte 20 der 22 getesteten Linien. Phylogenetische Analysen zeigten, dass alle taxonomisch anerkannten Spezies monophyletische Gruppen bilden. Hoplias malabaricus sensu stricto gruppierte sich innerhalb einer großen Gruppe, mit Ausnahme der Vertreter des La Plata River Basin. In der H.-lacerdae-Gruppe zeigten alle Arten außer H. curupira eine kohäsive Übereinstimmung zwischen taxonomischer und molekularer Identifizierung. Zwei verschiedene genetische Linien wurden für H. aimara gewonnen. Angesichts der unerwarteten versteckten mitochondrialen Diversität innerhalb von H. malabaricus wurde die COI-Sequenzzusammensetzung von Proben aus Suriname (der Typlokalität), identifiziert als H, identifiziert.
A continental-wide molecular approach unraveling mtDNA diversity and geographic distribution of the Neotropical genus Hoplias
Authors
Yamila P. Cardoso , Juan J. Rosso , Ezequiel Mabragaña, Mariano González-Castro, Matías Delpiani, Esteban Avigliano, Sergio Bogan, Raphael Covain, Nahuel F. Schenone, Juan M. Díaz de Astarloa
With an estimate of around 9,000 species, the Neotropical region hosts the greatest diversity of freshwater fishes of the world. Genetic surveys have the potential to unravel isolated and unique lineages and may result in the identification of undescribed species, accelerating the cataloguing of extant biodiversity. In this paper, molecular diversity within the valuable and widespread Neotropical genus Hoplias was assessed by means of DNA Barcoding. The geographic coverage spanned 40 degrees of latitude from French Guiana to Argentina. Our analyses revealed 22 mitochondrial lineages fully supported by means of Barcode Index Number, Automatic Barcode Gap Discovery and phylogenetic analyses. This mtDNA survey revealed the existence of 15 fully supported mitochondrial lineages within the once considered to be the continentally distributed H. malabaricus. Only four of them are currently described as valid species however, leaving 11 mitochondrial lineages currently “masked” within this species complex. Mean genetic divergence was 13.1%. Barcoding gap analysis discriminated 20 out of the 22 lineages tested. Phylogenetic analyses showed that all taxonomically recognized species form monophyletic groups. Hoplias malabaricus sensu stricto clustered within a large clade, excluding the representatives of the La Plata River Basin. In the H. lacerdae group, all species but H. curupira showed a cohesive match between taxonomic and molecular identification. Two different genetic lineages were recovered for H. aimara. Given the unexpected hidden mitochondrial diversity within H. malabaricus, the COI sequence composition of specimens from Suriname (the type locality), identified as H. malabaricus sensu stricto, is of major importance.
PDF zum runterladen [[File:journal.pone.0202024.pdf]]
notho2
hat folgende Dateien an diesen Beitrag angehängt
Aufgrund eingeschränkter Benutzerrechte werden nur die Namen der Dateianhänge angezeigt Jetzt anmelden!