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Nachweis der kryptischen Diversität in Süßwasser- Makrobrachium- Garnelen aus indochinesischen Flusssystemen durch DNA-Barcode, Artenabgrenzung und phylogenetische Ansätze
Nachweis der kryptischen Diversität in Süßwasser- Makrobrachium- Garnelen aus indochinesischen Flusssystemen durch DNA-Barcode, Artenabgrenzung und phylogenetische Ansätze.
Autoren
Warut Siriwut, Ekgachai Jeratthitikul, Somsak Panha, Ratmanee Chanabun, Peng Bun Ngor and Chirasak Sutcharit. 2021.
Evidence of Cryptic Diversity in Freshwater Macrobrachium Prawns from Indochinese Riverine Systems revealed by DNA Barcode, Species Delimitation and Phylogenetic Approaches.
Die Vielfalt der indochinesischen Garnelen der Gattung Macrobrachium ist aufgrund der Habitatdiversifizierung und der breiten Nebenflüsse zweier Flusseinzugsgebiete, des Chao Phraya und des Mekong, enorm. Trotz des langjährigen Interesses an der südostasiatischen Dekapoden-Diversität ist die subregionale Macrobrachium- Fauna im Hinblick auf taxonomische Identifizierung oder genetische Diversifizierung noch nicht umfassend geklärt. In dieser Studie wurden integrative taxonomische Ansätze einschließlich morphologischer Untersuchung, DNA-Barcoding und Abgrenzung molekularer Spezies verwendet, um die breit angelegte Systematik von Macrobrachium . hervorzuhebenGarnelen in Indochina. 27 nominelle Arten wurden erfolgreich durch traditionelle und molekulare Taxonomie erneut verifiziert. Die Strichcode-Lückenanalyse unterstützte eine breite Überlappung der Artengrenzen. Die taxonomische Mehrdeutigkeit mehrerer hinterlegter Proben in der öffentlichen Datenbank hängt mit der inter- und intraspezifischen genetischen Divergenz zusammen, wie durch die BOLD-Diskordanz angezeigt. Diagnostische Nukleotidpositionen wurden in sechs Macrobrachium- Spezies gefunden. Achtzehn zusätzliche mutmaßliche Abstammungslinien werden hierin unter Verwendung des Konsensus der Artenabgrenzungsverfahren zugeordnet. Die genetische Divergenz weist auf die mögliche Existenz von kryptischen Arten in vier morphologisch komplexen und weitreichenden Arten hin: M. lanchesteri, M. niphanae, M. sintangense und einigen Mitgliedern des M. pilimanusGruppe. Die geografische Verbreitung einiger Arten unterstützt die Verbindungen und Barrieren, die paläohistorischen Ereignissen von südostasiatischen Flüssen und Landmassen zugeschrieben werden. Die Ergebnisse dieser Studie zeigen explizit die Bedeutung von Süßwasser-Ökosystemen in indochinesischen Subregionen, insbesondere für das Mekong-Becken aufgrund seiner hohen genetischen Vielfalt und Artenzusammensetzung, die in seinen Nebenflüssen zu finden ist.
Abschluss
Diese Studie liefert die erste DNA-Barcode-Bibliothek und kryptische Beweise für die Gattung Macrobrachium in Indochina. Diagnostische Merkmale einiger Arten wurden anhand von Nukleotidpositionen nachgewiesen und können als zusätzliche Merkmale für die taxonomische Identifizierung und Artenvalidierung aufgenommen werden (S1-Tabelle). Trotz großer geografischer Streuung weisen mehrere Arten eine geringe genetische Affinität zwischen verschiedenen geografischen Populationen auf. Im Gegensatz dazu ist das morphologisch komplexe MacrobrachiumDie Artengruppe besitzt eine hohe genetische Vielfalt und die geografische Verbreitung zeigt Allopatrie zwischen den Einzugsgebieten des Chao Phraya und des Mekong. Die breit angelegten phylogenetischen Beziehungen der indochinesischen Arten aus dem COI-Datensatz sind noch ungelöst. Es gibt jedoch Beispiele für stabile Kladenzusammensetzung und monophyletische Abstammungslinien, insbesondere bei Mündungsarten. Die Abgrenzung der DNA-Spezies legt mehrere mögliche OTUs nahe, bei denen es sich möglicherweise um kryptische Arten handelt, die in gewöhnlichen Arten verborgen sind, wie z. B. M. lanchesteri, M. sintangense und M. pilimanusArtengruppen. Die Barcode-Lücken-Analyse liefert trotz der bei einigen Arten festgestellten hohen intraspezifischen Variation einen Abgrenzungsschwellenwert für indochinesische Taxa. Die unangemessene taxonomische Identifizierung einiger verfügbarer Sequenzen aus der öffentlichen Datenbank lässt Vorsicht walten und legt nahe, dass eine Rekonstruktion und erneute Überprüfung des Datensatzes für einen weiteren taxonomischen Vergleich erforderlich ist. Schließlich zeigen die Ergebnisse dieser Studie, dass die regionale Fauna mit anderen benachbarten Regionen wie Indien-Birma und Ostasien verbunden ist, wie die Aufzeichnungen einiger weit verbreiteter Arten zeigen.